阜陽市醫藥科技工程學校始建于1964年，先后舉辦安徽省舊縣農技校、太和五七干校、太和五七大學、太和師范、太和舊縣高中、太和農中、太和縣第一職業高級中學（太和縣醫藥管理學校）、阜陽市醫藥科技工程學校。1993年被評為阜陽地區重點職業高中，1995年被評為安徽省重點職業高中，2005年被評為安徽省示范中等職業學校，2008年通過安徽省示范中等職業學校復評，2015年6月被阜陽市人民政府批準改制為公辦全日制普通中專學校，2020年4月被安徽省教育廳列入省級特色示范中等職業學校重點建設學校。2020年12月通過安徽省教育廳中等職業教育B類辦學水平評估。系安徽省示范中等職業學校、安徽省現代農業職教集團理事單位、安徽省貧困地區勞動力轉移培訓基地。

學校現有兩個校區，占地面積317.46畝，建筑面積137275.4㎡，實驗實訓設備總價值2085.73萬元。學?，F有教職工202人，其中在編在崗164人，返聘1人，校聘專任教師19人，兼職教師18人，折合專任教師191人，專業課教師102人，雙師型教師77人，高級講師59人?，F有62個教學班，全日制在校生3793人。學?，F有圖書資源總量13.35萬冊，報刊雜志128種，16個校內外實習實訓基地；學校有集實驗、實訓、演示、交流、比賽、生產、研發于一體面積達4200多平方米的實訓樓和1692平米的實訓車間，包括6個微機室、錄播室、形體室、理實一體化教室、11個汽車實訓室、12個醫藥專業實訓室等；2022年，投入199.26萬元購置汽修專業實訓設備、投入148.40萬元購置醫藥農牧專業實訓設備、投入198.84萬元進行數字化建設、投入77.33萬元進行智慧教室建設，極大地改善了學校的辦學條件。

學校先后被評為“全國零犯罪學?！?、“全國國防教育先進?！薄鞍不帐∥拿鲉挝弧?、“全省書法教育示范?！?、“阜陽市平安校園”、“阜陽市職業教育先進單位”等。

學校堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，堅持面向市場，面向生產一線，服務地方經濟和社會發展。積極對接太和縣現代醫藥、綠色新能源、發藝文化、工業濾布等支柱產業，圍繞“學校創品牌，教師養品味，學生修品能”的辦學目標，以“品能教育”為依托，深化產教融合、校企合作和工學結合，培養具有綜合職業能力的應用型、技能型、創新型中等技術人才。

學校以“品能教育”為依托，實施“三進教學”模式，即企業進校園、師傅進課堂、學生進車間；積極開展現代學徒制；實施中高職銜接人才培養，先后與阜陽職業技術學院、六安職業技術學院、安徽省林業職業技術學院聯合舉辦“3+2”五年一貫制大專班；加強思想道德建設，形成了安全系列教育、國防教育、傳統文化進校園等特色辦學模式。

學校制定了“13456”行動計劃統領各項工作?！?”即一個目標：全市一流、全省領先；“3”即三層共進：招生、就業、升學齊頭并進；“4”即打造四類課型：文化課做“實”，專業課做“精”，實訓課做“品”，校本課做“特”；“5”即抓好五項建設：活力科室、和諧教研組、魅力年級組、美麗班級、班級生態小組；“6”即夯實六項工程：師生健康工程、教學質量工程、讀書工程、校園文化建設工程、信息化建設工程、高效課堂建設工程。